After Effects 和 Premiere Pro 一直是動畫合成效果和剪輯的最佳 搭檔,不僅在 After Effects 可以直接開啟(設定) Premiere Pro 的 Sequence,也可以反向的在 Premiere Pro 中直接開啟(設定)After Effects 的 Comp,這樣使得操作者不管進行剪輯或動畫特效都能善用 軟體的特長,而不必先輸出成影片再進行編輯,在操作感覺上更像 ㄧ套模組化了的超級軟體。
新版本的 After Effects 和 Premiere Pro 同時增加更多的輸出與輸入的 媒體,在高解析度格式支援上,除了原有的 HDTV/Blu-ray Disc 藍光 高解析光碟、AVC-Intra 格式、Panasonic P2 與 Sony XDCAM EX 格式 之外,更支援數位電影檔案格式,如 ARRI 格式、Blackmagic Design 格式和 RED R3D 格式,高達 4K ~ 5K 的超高解析度。
另外就是改良的 RAM Preview 弁,內置的 3D Camera Tracking 能,Rolling Shutter 修正弁,更精細的 Feather Mask,Mocha forAfter Effects CS6,更好的整合 2D 和 3D 圖層和動畫等。這使得 After Effects + Premiere Pro 成為當前視訊剪輯與動畫特效領域上最強, 同 時整合性也最好的系列軟體之一。