101年史前館面臨兩大變化，第一，是由教育部改隸文化部，基本功能雖維持不變，但施政重點配合文化部「泥土化、國際化、產值化、雲端化」等四大施政方向；第二，經費遭遇政府整體財政困難的統刪、以及不能再獲教育部每年一兩千萬補助款的雙重壓力。但在全體同仁共同的努力之下，仍有豐碩的成果。